Туберкулез является распространенной инфекцией. По данным Всемирной организации здравоохранения, 1/3 населения земного шара инфицирована микобактериями туберкулеза. Ежегодно им заболевают 10 млн человек, умирают 1,2 млн и еще 208 тыс. – от коинфекции туберкулез/ВИЧ [1].
На современном этапе большое внимание уделяют генетической предрасположенности к развитию ряда заболеваний, в том числе обусловленной воздействием опасных химических веществ на различные системы детоксикации.
Активно изучается роль генов, контролирующих синтез и работу ферментов биотрансформации ксенобиотиков (ФБК), в частности изоферментов цитохрома Р450 и ферментов II фазы биотрансформации (N-ацетилтрансферазы, глутатион-S-трансферазы), в возникновении нежелательных реакций при химиотерапии туберкулеза, в первую очередь гепатотоксических.
В настоящее время проводят исследования влияния полиморфизмов генов, регулирующих процессы биотрансформации, на развитие мультифакториальных заболеваний, которые могут быть спровоцированы действием внутренних и внешних факторов, в том числе химическим воздействием. Несмотря на многочисленные исследования в области генетики инфекционных заболеваний, многие аспекты функционирования генов, определяющих развитие защитных реакций при внедрении патогена, остаются до конца не установленными.
Имеющиеся данные о сложном механизме процессов биотрансформации и ее генетическом регулировании требуют уточнения ее роли в системе поддержания гомеостаза организма в сочетании с другими защитными механизмами.
Разнообразные токсические вещества и продукты их биотрансформации оказывают влияние на различные звенья иммунной системы, поэтому сведения об иммунотропных свойствах ксенобиотиков и защитной роли звеньев иммунитета в реализации токсических эффектов ксенобиотиков активно изучаются.
Исследованиями ряда ученых сформулирована концепция функционального единства механизмов иммунологического и химического гомеостаза, связанных с функциями печени и других барьерных органов. В процессе защиты организма от чужеродных химических соединений возникают сопряженные реакции двух типов: индукция синтеза микросомальных монооксигеназ печени и индукция синтеза специфических антител, связывающих ксенобиотики.
В проведенных исследованиях установлено, что генотип del/del (D/D) гена GSTM1 статистически значимо ассоциировался с повышенным риском развития туберкулеза легких, тогда как носительство генотипа del/del (D/D) гена GSTT1 ассоциировано с пониженным риском развития этого заболевания, в то время как полиморфизм 3435T>C ABCB1 (генотип TС) ассоциировался с повышенной восприимчивостью к туберкулезу легких. Мы проанализировали ассоциации аллельных вариантов генов ФБК и цитокинов с предрасположенностью к формированию деструкции в легочной ткани у больных с впервые выявленным туберкулезом легких. Показано, что отсутствие деструктивных изменений в 89,5% случаев ассоциировалось с носительством генотипа ЕЕ (отсутствие делеции) гена GSTM1 (p<0,0001), в то время как генотип DD (наличие делеции) гена GSTM1 в 56,1% статистически значимо (p<0,0001) ассоциировался с наличием деструктивных изменений в легких.
Полученные результаты свидетельствуют, что носительство определенных генотипов ферментов метаболизма ксенобиотиков может оказывать существенное влияние на восприимчивость к возникновению туберкулеза легких.
В исследуемой популяции проанализированы частоты аллелей 3 полиморфных вариантов генов ФБК. Использовали гомогенную по этническому составу популяционную выборку неродственных индивидов славянских национальностей (преимущественно русских), проживающих на территории Курской области, общей численностью 869 индивидов. Данная выборка включала пациентов с хроническим туберкулезом легких (n=123) и популяционную выборку относительно здоровых индивидов из биобанка НИИ генетической молекулярной эпидемиологии ФГБОУ ВО КГМУ (n=746), собранную за период с 2003 по 2017 г. в рамках проводившихся ранее генетико-эпидемиологических исследований различных мультифакториальных заболеваний.
В табл. 1 представлены частоты аллелей полиморфизмов генов ФБК и цитокинов у жителей Курской области в сравнении с европейской популяцией согласно данным dbSNP.
Таблица 1. Частоты аллелей полиморфизмов генов ФБК у больных с торпидно-текущим ТЛ в сравнении с европейской популяцией
Ген |
Полиморфизм (rs ID) |
Аллель |
Частоты аллелей |
Уровень значимости различий в частотах аллелей, p |
|||
Больные с хроническим туберкулезом (n=123) n |
Частота аллеля |
Контрольная группа (n=746) |
Европейская популяция (n=1006) |
||||
NAT2 |
590G>A (rs1799930) |
G |
123 |
0,711 |
0,757 |
0,718 |
0,2 |
A |
0,289 |
0,243 |
0,282 |
||||
CYP2E1 |
9896C>G (rs2070676) |
C |
123 |
0,947 |
0,971 |
0,872 |
0,25 |
G |
0,053 |
0,029 |
0,128 |
||||
ABCB1 |
3435T>C (rs1045642) |
T |
123 |
0,496 |
0,543 |
0,518 |
0,24 |
C |
0,504 |
0,457 |
0,482 |
В дальнейшем стало интересно провести анализ ассоциации генотипов ФБК с формированием клинических форм хроническеского туберкулеза легких (таблица 2).
Таблица 2. Ассоциация генотипов ФБК у больных с хроническим туберкулезом легких с предрасположенностью к определенным клинических формам
Ген |
SNP D |
Генотип |
Клинические формы ТЛ |
Контрольная группа |
|||
ОТЛ |
ИТЛ |
ДТЛ |
ФКТЛ |
||||
GSTM1 |
E/D |
EE, абс. |
1 |
5* |
13* |
20** |
384 |
% |
50 |
25 |
35,7 |
42,4 |
51,5 |
||
DD, абс. |
1 |
15* |
27* |
41** |
362 |
||
% |
50 |
75 |
64,3 |
57,6 |
48,5 |
||
GSTT1 |
E/D |
EE, абс. |
1 |
17 |
38* |
41** |
615 |
% |
100 |
88 |
95,7 |
75 |
82,4 |
||
DD, абс. |
1 |
3 |
2* |
20** |
131 |
||
% |
0 |
12 |
4,3 |
25 |
17,6 |
||
NAT2 |
590G>A (rs1799930) |
GG, абс. |
1 |
8 |
20 |
35 |
361 |
% |
50 |
34,8 |
61,4 |
50 |
48,4 |
||
GA, абс. |
0 |
10 |
17 |
26 |
315 |
||
% |
0 |
52,2 |
31,8 |
50 |
42,2 |
||
AA, абс. |
1 |
2 |
3 |
0 |
70 |
||
% |
50 |
13 |
6,8 |
0 |
9,4 |
||
CYP2E1 |
9896C>G (rs2070676) |
CC, абс. |
1 |
3 |
9** |
15** |
223 |
CG, абс. |
0 |
12 |
20,5 |
28,8 |
29,9 |
||
GG, абс. |
1 |
13 |
22** |
31** |
364 |
||
ABCB1 |
3435T>C (rs1045642) |
TT, абс. |
100 |
72 |
59,1 |
42,3 |
48,8 |
% |
0 |
4 |
9 |
15 |
159 |
||
TC, абс. |
0 |
16 |
20,5 |
28,8 |
21,3 |
||
% |
2 |
20 |
30 |
53 |
703 |
||
CC, абс. |
0 |
0 |
10 |
8 |
42 |
||
% |
0 |
0 |
0 |
0 |
1 |
Примечание: *р<0,05, **р<0,01.
В ходе исследования показано, что генотип DD гена GSTM1 статистически значимо ассоциируется с предрасположенностью к ИТЛ, ДТЛ, ФКТЛ, в то время как генотип ЕЕ данного гена ассоциирован с восприимчивостью к ИТЛ, ДТЛ, ФКТЛ.
Генотип ЕЕ гена GSTT1 статистически значимо ассоциирован с формированием ДТЛ, ФКТЛ, в то время как генотип DD данного гена – с ДТЛ и ФКТЛ.
Генотип GG гена CYP2E1 статистически значимо ассоциирован с формированием ДТЛ, ФКТЛ, в то время как генотип СС – с ДТЛ и ФКТЛ.
Резюмируя изложенное, отметим:
Частота вариантного аллеля 9896G полиморфизма rs2070676 гена CYP2E1 в 4 раза ниже в курской популяции в сравнении со среднеевропейской частотой аллеля. В то же время частоты аллелей полиморфных вариантов генов ФБК, таких как NAT2 590G>A (rs1799930) и ABCB1 3435T>C (rs1045642), сопоставимы с таковыми в европейских популяциях.
Полиморфизм исследуемых генов ФБК у жителей Курской области характеризуется широким аллельным разнообразием. Уровень наблюдаемой гетерозиготности варьировал от Ho=0,053 для полиморфизма 9896C>G (rs2070676) гена CYP2E1 до Ho=0,537 для полиморфизма 3435T>C (rs1045642) гена ABCB1.
Генотип ЕЕ гена GSTM1 ассоциировался с пониженной восприимчивостью к торпидно-текущему ТЛ (р<0,0001).
Генотип СС гена 9896C>G (rs2070676) CYP2E1 ассоциировался с повышенной восприимчивостью к торпидно-текущему ТЛ (р=0,04).
Генотип DD гена GSTM1 статистически значимо ассоциируется с формированием ИТЛ, ДТЛ и ФКТЛ.
Генотип GG гена CYP2E1 статистически значимо ассоциирован с формированием ДТЛ и ФКТЛ.