Введение
Открытие антигенов тканевой совместимости у человека HLA положило начало успешному развитию исследований по тканевой совместимости и распределению компонентов комплекса HLA в популяциях. В условиях экспедиций в ряде регионов России и странах постсоветского пространства проведены комплексные клинические, генетико-эпидемиологические и иммунологические исследования групп коренного населения с различной этнической принадлежностью и эпидемической ситуацией по туберкулезу [3].
Изучение распределения компонентов комплекса HLA среди здорового населения и у больных туберкулезом легких проведено в русской, татарской, узбекской, туркменской, молдавской, тувинской популяциях. Для каждой популяции обнаружены свои особенности в частотах встречаемости антигенов HLA и характерные для данной популяции ассоциации с восприимчивостью (или резистентностью) к туберкулезу легких [3].
С генетической точки зрения туберкулез, как и большинство инфекционных болезней, относится к мультифакториальным заболеваниям, возникающим в результате сложного взаимодействия большого числа генов с разнообразными факторами внешней среды. В связи с этим одни индивидуумы обладают эффективной врожденной устойчивостью к туберкулезной инфекции, тогда как другие подвержены развитию болезни при контакте с ее возбудителем [1, 5, 8].
Гены ферментов биотрансформации ксенобиотиков (ФБК), как и все гены человека, характеризуются значительным полиморфизмом первичной нуклеотидной последовательности ДНК, которой определяются межиндивидуальные фенотипические различия в активности энзимов по обезвреживанию ксенобиотиков [9].
С позиции изучения вклада генотипа макроорганизма в развитие различных болезней, в том числе и туберкулеза, особую актуальность приобретает исследование системы генов метаболизма ксенобиотиков, поскольку ферментами этой системы осуществляется метаболизм не только большинства разнообразных по химической структуре экзогенных молекул, но и многочисленных эндогенных веществ, например, медиаторов воспаления, маркером которых является и С-реактивный белок. Система ферментов метаболизма ксенобиотиков представляет собой сформировавшийся в процессе эволюции механизм адаптации организма к воздействию токсичных экзогенных и эндогенных веществ.
Предполагается, что различия в скорости деградации различных субстратов ферментами метаболизма могут лежать в основе неодинаковой восприимчивости к ряду заболеваний [4, 11].
Известно, что большинство бронхолегочных заболеваний в той или иной степени связаны с развитием окислительного стресса. Эффективной защитой от различных токсикантов внешней среды, поступающих с вдыхаемым воздухом, служит система биотрансформации ксенобиотиков при согласованном функционировании защитных механизмов. Глутатион S-трансферазы – семейство ферментов, участвующих в метаболизме большого числа электрофильных ксенобиотиков через конъюгацию с глутатионом, а также в метаболизме ряда эндогенных субстратов (гормонов, липидов, простагландинов, лейкотриенов) [6].
Многочисленные исследования генов системы метаболизма ксенобиотиков показали связь с различными заболеваниями, включая сердечно-сосудистые и атопические заболевания, хронические неспецифические заболевания легких, в том числе и туберкулез [2]. В ряде научных работ полиморфизмы генов ФБК ассоциировались с риском развития панкреатита и гипертонической болезни [10, 12].
Глутатионопосредованная детоксификация принимает непосредственное участие в защите организма от оксидативного стресса, что оправдывает изучение полиморфизма генов глутатион S-трансфераз в патогенезе различных патологических состояний, в том числе и при туберкулезе [2].
Цель исследования: исследовать взаимосвязь полиморфных вариантов генов ферментов метаболизма биотрансформации ксенобиотиков (NAT2 (590G>A (rs1799930)), CYP2E1 (9896C>G (rs2070676)), ABCB1 (3435T>C (rs1045642)),GSTM1 (E/D), GSTT1 (E/D) с восприимчивостью к заболеванию туберкулезом легких.
Материал и методы
В исследование включено 335 больных туберкулезом органов дыхания в возрасте от 18 до 65 лет (212 пациентов с впервые выявленным туберкулезом легких и 123 ‒ с хронически текущим туберкулезом легких, получающих интенсивную фазу химиотерапии в ОБУЗ «Областной клинический противотуберкулезный диспансер», г. Курск).
Контрольную группу составили 746 человек, относительно здоровых, не имеющих хронических заболеваний. Критерием невключения в исследование явилось наличие у пациентов тяжелых сопутствующих заболеваний (злокачественные новообразования, системные заболевания кровеносной системы, сердечно-легочная и почечная недостаточность в стадии декомпенсации, резкое истощение, анемия, тиреотоксикоз, психические заболевания).
Среди 335 больных туберкулезом легких мужчин было 76,7% (257 чел.), женщин ‒ 23,3% (78 чел.). Средний возраст пациентов составил 46,4 года.
Структура клинических форм туберкулеза легких была следующей:
инфильтративный – у 135 (40,3%) пациентов,
диссеминированный – у 118 (35,2%),
фиброзно-кавернозный ‒ у 66 (19,7%),
очаговый – у 16 (4,8%) пациентов.
В 38,7% случаев туберкулезный процесс выявлен активно при периодических флюорографических обследованиях, а в 61,3% ‒ при обращении к врачу с жалобами, как правило, респираторного характера.
В рамках данного исследования использовалась гомогенная по этническому составу выборка неродственных индивидов славянских национальностей (преимущественно русских), проживающих на территории Курской области, которая включала пациентов с легочной формой туберкулеза (n = 335).
Для формирования контрольной группы в исследование включены данные генотипирования интересуемых полиморфизмов у относительно здоровых добровольцев (n = 746) из выполненного ранее исследования в Курском государственном медицинском университете [7].
Генотипирование пациентов с туберкулезом легких проводилось в иммунологической лаборатории ООО «Томограф» (г. Курск).
Для проведения молекулярно-генетической части работы были отобраны полиморфные варианты генов ФБК, которые наиболее часто исследовались в мире в качестве ДНК-маркеров в рамках фар- макогенетических исследований. При этом были отобраны наиболее функционально значимые полиморфные локусы, которые на фенотипическом уровне характеризуются значительными межиндивидуальными различиями в активности или экспрессии ферментов.
Статистическая обработка данных проводилась на персональном компьютере с использованием программных пакетов Statistica 10.0 Neural Nets и MS Excel 2013.
Для оценки соответствия распределений генотипов ожидаемым значениям при равновесии Харди ‒ Вайнберга использовали критерий χ2 Пирсона. Ассоциации аллелей и генотипов изученных ДНК-маркеров с восприимчивостью к туберкулезу легких оценивали с помощью анализа таблиц сопряженности 2 × 2 с расчетом критерия 2 (df = 1) и отношения шансов (OR) с 95%-ными доверительными интервалами (CI).
Результаты исследования
В исследуемой популяции проанализированы ассоциации аллельных вариантов генов ФБК с заболеванием туберкулезом легких (табл. 1).
Установлено, что генотип del/del (D/D) GSTM1 ассоциировался с наибольшей восприимчивостью к заболеванию туберкулезом легких, тогда как носительство генотипа del/del (D/D) GSTT1 было ассоциировано с пониженной восприимчивостью к данному заболеванию. Выявленные ассоциации делеционных генотипов GSTM1 (OR = 1,33, 95% CI 1,03-1,72) и GSTT1 (OR = 0,60, 95% CI 0,4-0,87) с туберкулезом оставались статистически значимыми после коррекции по полу, возрасту и курению (p = 0,01 для обоих генотипов).
В табл. 2 для полиморфизмов NAT2 590G>A (rs1799930), CYP2E1 –1293G>C (rs3813867) и ABCB1 3435T>C (rs1045642) представлены данные по ассоциациям генотипов в рамках тестирования кодоминантной генетической модели.
Таблица1.ВлияниеассоциациигенотиповФБКназаболеваниетуберкулезомлегкихужителейКурскойобласти
Ген |
Однонукле-отидныйполиморфизм |
Генотипы |
Частоты генотипов,n(%) |
P-уровень |
OR(95%CI)¹ |
|||
больныетуберкулезом(n=335) |
контрольнаягруппа(n=746) |
|||||||
абс. |
% |
абс. |
% |
|||||
GSTM1 |
E/D |
EE |
149 |
44,5 |
385 |
51,6 |
0,03 |
1,00 |
DD |
186 |
55,5 |
361 |
48,4 |
1,33(1,03-1,72) |
|||
GSTT1 |
E/D |
EE |
298 |
89,0 |
616 |
82,6 |
0,01 |
1,00 |
DD |
37 |
11,0 |
130 |
17,4 |
0,60(0,4-0,87) |
|||
NAT2 |
590G>A(rs1799930) |
GG |
158 |
47,2 |
362 |
48,5 |
0,18 |
1,00 |
GA |
158 |
47,2 |
314 |
42,1 |
1,23(0,95-1,59) |
|||
AA |
19 |
5,7 |
70 |
9,4 |
0,58(0,34-0,98) |
|||
CYP2E1 |
9896C>G(rs2070676) |
CC |
311 |
92,8 |
703 |
94,2 |
0,37 |
1,00 |
CG |
24 |
7,2 |
42 |
5,6 |
1,29(0,77-2,17) |
|||
GG |
0 |
0,0 |
1 |
0,1 |
- |
|||
ABCB1 |
3435T>C(rs1045642) |
TT |
80 |
23,9 |
223 |
29,9 |
0,04 |
1,00 |
TC |
172 |
51,3 |
364 |
48,8 |
1,11(0,86-1,43) |
|||
CC |
83 |
24,8 |
159 |
21,3 |
1,22(0,9-1,65) |
Примечание: 1 – отношения шансов и 95%-ные доверительные интервалы для ассоциаций генотипов ФБК с риском развития легочного туберкулеза (кодоминантная модель)
Как видно из табл. 1, указанные полиморфизмы не показали статистически значимых различий при тестировании кодоминантной модели, за исключением полиморфизма 3435T>C ABCB1 (генотип TС), который ассоциировался с повышенной восприимчивостью к туберкулезу легких (OR = 1,11, 95% CI 0,86-1,43; p = 0,04).
Однако при тестировании других генетических моделей было выявлено, что отдельные полиморфизмы могут быть ассоциированы с восприимчивостью к туберкулезу легких (табл. 2). В частности, установлено, что полиморфизм 3435T>C гена ABCB1 был ассоциирован с повышенной восприимчивостью к туберкулезу легких в рамках модели доминирования (OR = 1,36, 95% CI 1,01-1,83, p = 0,04).
Таким образом, одним из предполагаемых функциональных механизмов, лежащих в основе полученных ассоциаций генотипов, может быть участие белковых продуктов соответствующих генов в метаболизме эндогенных ксенобиотиков, в том числе многочисленных медиаторов воспалительных реакций, поскольку метаболизм ксенобиотиков через
Таблица 2. Влияние ассоциации генотипов ФБК на восприимчивость к туберкулезу легких у жителей Курской области в рамках модели доминирования
Ген |
Однонукле-отидныйполиморфизм |
Генотипы |
Частоты генотипов,n(%) |
P-уровень |
OR(95%CI)¹ |
|||
больныетуберкулезом(n=335) |
здоровые(n=746) |
|||||||
абс. |
% |
абс. |
% |
|||||
ABCB1 |
3435T>C(rs1045642) |
ТС |
80 |
23,9 |
364 |
48,8 |
0,04 |
1,36(1,01-1,83) |
TT+CC |
255 |
76,1 |
382 |
51,2 |
глутатион-опосредованную детоксикацию играет важную роль в обеспечении устойчивости клеток к перекисному окислению жиров, свободным радикалам, алкилированию белков, в формировании резистентности к лекарственным препаратам и предотвращении поломок ДНК.
Выводы
1. Наличие определенных генотипов ферментов метаболизма ксенобиотиков может оказывать существенное влияние на восприимчивость к развитию туберкулеза легких.
2. Проведенные исследования влияния ассоциации генотипов ФБК на вероятность развития туберкулеза легких у жителей Курской области показали, что генотип del/del (D/D) GSTM1 ассоциировался с повышенной восприимчивостью к туберкулезу легких, тогда как носительство генотипа del/del (D/D) GSTT1 ассоциировано с пониженной восприимчивостью к данной болезни.
3. Полиморфизм 3435T>C ABCB1 (генотип TС) ассоциировался с повышенной восприимчивостью к туберкулезу легких в рамках модели кодоминирования, а генотипы ТТ+ТС – в рамках модели доминирования.
Список литературы
1. Белушкина Н. Н., Чемезов А. С., Пальцев М. А. Генетические исследования мультифакториальных заболеваний в концепции персонализированной медицины // Профилактическая медицина. ‒ 2019. ‒ № 3. ‒ С. 26-29.
2. Брагина Е. Ю. Сравнительный анализ структуры наследственной ком- поненты подверженности к бронхиальной астме и туберкулезу по ге- нам ферментов метаболизма ксенобиотиков: Дисс. … канд. биол. наук: 03.00.15. – Томск, 2005. ‒ 140 с.
3. Гергерт В. Я., Валиев Р. Ш., Чуканова В. П., Поспелов Л. Е., Маленко А. Ф., Валиев Н. Р. Распределение антигенов комплекса HLA у больных тубер- кулезом и здоровых лиц в татарской популяции // Пробл. туб. – 2004. ‒ № 8. – С. 45-46.
4. Землякова М. А., Кольдибекова Ю. В. Современные подходы к оценке нарушений метаболизма ксенобиотиков при поступлении в организм из внешней среды // Экология человека. – 2012. ‒ Т. 8. ‒ С. 8-13.
5. Коненков В. И., Смольникова М. В. Полиморфизм промоторных регионов генов IL4 и 10 и фактора некроза опухолей α у ВИЧ-инфицированных // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. – 2002. – Т. 133, № 4. – С. 449-451.
6. Меньшикова Е. Б., Зеньков Н. К. Современные подходы при анализе окислительного стресса, или как измерить неизмеримое // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. ‒ 2016. ‒ Т. 1, № 3 (109). – С. 174-179.
7. Полоников А. В. Полиморфизм генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков и их комплексное влияние на предрасположенность к мультифакториальным заболеваниям: Дисс. д-ра мед. наук: 03.00.15. ‒ М., 2006. ‒ 442 с.
8. Пузырев В. П., Фрейдин М. Б., Кучер А. Н. Генетическое разнообразие народонаселения и болезни человека. – Томск: Печатная мануфактура, 2007. – 320 с.
9. Чурносов М. И., Полякова И. С., Пахомов С. П., Орлова В. С. Молекуляр- ные и генетические механизмы биотрансформации ксенобиотиков // На- учные ведомости Белгородского университета. ‒ 2011. ‒ № 16. ‒ С. 223-228.
10. Bushueva O. Yu. Single nucleotide polymorphisms in genes encoding xenobiotic metabolizing enzymes are associated with predisposition to arterial hypertension // Research Results in Biomedicine. ‒ 2020. ‒ Vol. 6, № 4. ‒ Р. 447-456. DOI: 10.18413/2658-6533-2020-6-4-0-1.
11. Danielle K., Pelkonen O., Ahokas T. Hepatocytes: The powerhouse of biotransformation // The International Jounal of Biochemistry & Cell Biology. ‒ 2012. ‒ Vol. 44. ‒ P. 257-265.
12. Samgina T. A. Influence of some risk factors and rs1799930 polymorphism of the NAT2-590 G>A gene on the development of chronic pancreatitis // Research Results in Biomedicine. ‒ 2021. ‒ Vol. 7, № 2. ‒ Р. 143-148. Russian]. DOI: 10.18413/2658-6533-2021-7-2-0-4.