СВЯЗЬ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕТЕРМИНАНТ И ФЕНОТИПИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК ГИПЕРВИРУЛЕНТНОСТИ У КЛИНИЧЕСКИХ ШТАММОВ K. PNEUMONIAЕ - Студенческий научный форум

XVI Международная студенческая научная конференция Студенческий научный форум - 2024

СВЯЗЬ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕТЕРМИНАНТ И ФЕНОТИПИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК ГИПЕРВИРУЛЕНТНОСТИ У КЛИНИЧЕСКИХ ШТАММОВ K. PNEUMONIAЕ

Самойлова А.А. 1, Краева Л.А. 1, Светлов Д.Д. 2
1ФБУН НИИэм. им. Пастера
2СПБПУ
 Комментарии
Текст работы размещён без изображений и формул.
Полная версия работы доступна во вкладке "Файлы работы" в формате PDF

Цель. Определить связь между генетическими детерминантами и фенотипическими характери- стиками гипервирулентности у клинических штам- мов Klebsiella pneumoniae.

Материалы и методы. В исследовании исполь- зовали 85 клинических штаммов K. pneumoniae, полученных от госпитализированных пациентов Санкт-Петербурга. Фенотипические характери- стики гипервирулентности определяли при помо- щи «стринг-теста» [1]. Генотипические детерми- нанты гипервирулентности (iroB, entB, iucA, iutA, irp2, MagA, Wzy, prmpA, prmpA2, crmpA) [2–4] определяли при помощи ПЦР. Ожидаемые разме- ры ампликонов подтверждали электрофорезом. Для оценки достоверности различий между долями использовали критерий Фишера. Расчеты про- изводили с помощью программного пакета Microsoft Excel. Выбранный уровень достоверно- сти составлял 0,99.

Результаты и их обсуждение. Среди исследо- ванных штаммов K. pneumoniae на основании «стринг-теста» было выявлено 32,9% изолятов с гипермукоидным фенотипом. Гены синтеза сиде- рофоров энтеробактина (entB), сальмохелина (iroB) и иерсиниабактина (irp2), были обнаружены у 100%, 18,8% и 80% штаммов соответственно. Гены синтеза сидерофора аэробактина iucA и iutA

были характерны для 30,6% и 78,8% изолятов. Плазмидные гены регуляторов мукоидного фено- типа (prmpA или prmpA2) присутствовали в 55,3% и 76,5% штаммах, а хромосомный ген crmpA обна- ружен не был. Гены MagA и wzy, связанные с кап- сульными типами K1 и K2, были характерны для 8,2% и 30,6% штаммов.

Генетические маркеры iucA, rmpA/rmpA2 и iroB обычно расположены на плазмиде вирулентности и на основании данных литературы наиболее часто связаны с гипервирулентностью. В проведенном исследовании у 16% штаммов вышеперечисленные гены присутствовали одновременно. 92,8% штам- мов, имеющих данную комбинацию генов, показали положительный результат стринг-теста. У 100% штаммов, не имеющих ни одного из данных генов, результат стринг-теста был отрицательный.

Заключение. При отрицательном результате стринг-теста в 100% случаев наблюдалось отсут- ствие комбинации генов iucA, rmpA/rmpA2 и iroB. В то же время сделать вывод о вирулентности штамма по результатам стринг-теста не представ- ляется возможным вследствие большого количе- ства ложноотрицательных результатов, связанных с отсутствием гипермукоидного фенотипа у значи- тельного числа штаммов, обладающих генетиче- скими детерминантами вирулентности.

 

ЛИТЕРАТУРА/REFERENCES

1. Russo T.A., Olson R., Fang C.T, Stoesser N., Miller M., MacDonald U., Hutson A., Barker J.H., La Hoz R.M., Johnson J.R. Identification of Biomarkers for Differentiation of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae from Classical K. pneumoniae // Journal of Clinical Microbiology. 2018. Vol. 56, No. 9. e00776–18. doi: 10.1128/JCM.00776-18.

 
   

86 HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2023, Vol. 15, No. 1

2. Parrott A.M., Shi J., Aaron J., Green D.A., Whittier S., Wu F. Detection of multiple hypervirulent Klebsiella pneumoniae strains in a New York City hospital through screening of virulence genes // Clinical Microbiology and Infection. 2021. Vol. 27, No. 4. P. 583–589. doi: 10.1016/j.cmi.2020.05.012.

3. Turton J.F., Baklan H., Siu L.K., Kaufmann M.E., Pitt T.L. Evaluation of a multiplex PCR for detection of serotypes K1, K2 and K5 in Klebsiella sp. and comparison of isolates within these serotypes // FEMS Microbiology Letters. 2008. Vol. 284. P. 247–252. doi: 10.1111/j.1574- 6968.2008.01208.x.

Просмотров работы: 3