Актин присутствует в клетках всех эукариот и является, таким образом, одним из важнейших структурных белков. Однако у различных эукариотических организмов нуклеотидные последовательности одного и того же гена могут довольно сильно различаться. Также вероятно наличие некоторых высоко консервативных нуклеотидных последовательностей. В данной работе проведён биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей гена актина α-1 пяти эукариотических организмов: Человек разумный (Homo sapiens), Дикий бык (Bos taurus), Домовая мышь (Mus musculus), Курица (Gallus gallus) и Серая крыса (Rattus norvegicus). Проведено множественное выравнивание указанного гена при помощи программного обеспечения «UGENE-1.25.0». Результаты представлены на рис.1.
Рис. 1. Результаты множественного выравнивания гена актина α-1 Actn1.
Как видно из результатов множественного выравнивания, ген Actn1 характеризуется средней степенью гомологии в рамках данной выборки организмов. Стоит отметить, что каждый раз в разных положениях нуклеотидов наблюдается гомология между разными организмами, а не между одними и теми же на протяжении всей последовательности. Это свидетельствует о высокой степени консервативности данного гена.
Библиографический список:
1. Б. Альбертс, Д. Брей, Дж. Льюис, М. Рефф, К. Робертс, Дж. Уотсон, Молекулярная биология клетки — В 3-х т. — Пер. с англ. — Т.2. — М.: Мир, 1994. — 540 с.
2. Васильев Ю. М. Клетка как архитектурное чудо. Ч. 2. Цитоскелет, способный чувствовать и помнить // Соросовский Образовательный Журнал. 1999. №4. С. 4-10.